Может быть присылать браузерные уведомления (маленькие окошки с текстом сообщения, вылезающие в правом нижнем бразеров), для более четкого понимания того о чем я говорю, попробуйте посидеть с Хрома Вконтакте или на trello.com. Эти сайты вам предложат уведомления и посмотрите как это выглядит.
Я предлагаю присылать через уведомления сообщения в теме, созданной пользователем и сообщения в чужик темах с упоминанием имени пользователя.