Как правило, Апорт индексирует все документы, найденные его роботом по ссылкам на сайте, за исключением документов, в Url которых встречается символ "?" (для них применяются специальные правила, см. об этом ниже). Это правило может не соблюдаться для больших по объему сайтов, а также для сайтов, замеченных в применении спама.

Следует учитывать, что полная индексация сайта может происходить постепенно, а также то, что содержание базы является прерогативой поисковой системы и каких-либо гарантий по индексации (а также сохранению в индексе уже проиндексированных документов) Апорт не дает.

Документы, содержащие в Url символ "?", индексируются апортом выборочно, с использованием квотирования количества таких документов для каждого сайта. Размер квоты вычисляется автоматически в зависимости от ряда условий, в частности от индекса цитируемости сайта, и может, в частности, быть для некоторых сайтов нулевым.